Bola-DRB 3.2基因的多态性和坦桑尼亚短路Zebu牛四种菌株中的相关遗传关系
Keywords:
等位基因,疾病耐受性,遗传变异,主要组织相容性复合物,菌株,坦桑尼亚Zebu
抽象的
牛淋巴细胞抗原(BOLA)基因在牛对传染病的抵抗力或易感性中起重要作用。 Bola基因包含几个基因座,包括最多的多晶型位点,即DRB 3.2。我们扩增了200个DNA样品并测序270bp,其包含Bola-DRB 3.2的外显子2在坦桑尼亚短路Zebu(TSZ)牛(Tarime,Sukuma,Maasai,Singida White)和一种品种,即弗里斯氏菌。在Finch TV上处理序列,在基本的局部对准搜索工具(Blast)上对齐,并与使用Mega的氨基酸匹配。每种等位基因的频率被计算为每种群体中总等位基因的比例。 Chi-Square用于测试等位基因频率的重要性。使用Poptree 2计算杂合子2.通过NEI遗传距离评估推定的进化关系。确定了三十四个等位基因,其中九个等位基因是新的。最多的等位基因在塔克里和辛迪达白色和最低的弗里斯队中确定了最多的等位基因。动物内杂合性高。系统发育树为TSZ的两个主要集群显示为TSZ,一秒钟为摩托车。 TSZ中DRB 3.2的多态性可能是他们承受各种疾病的能力的解释,我们建议在品种中进一步评估